Temperatureinstellungen erfolgen am Gerät, durch Fernsteuerungen oder über eine Smartphone-App.

In Pelletöfen nach heutigem Stand der Technik, können die jeweils gewünschten Solltemperaturen, Zeit- und Wochentag-Programmierungen, Nachtabsenkungen und ähnliche Features direkt am Gerät konfiguriert werden.

In der Regel ist auch noch eine externe Schnittstelle, z. B. ein potenzialfreier Schalteingang vorhanden. Über diesen kann der Pelletofen mit einer separaten, externen, Steuerung verbunden werden. Dies ermöglicht etwa den Einsatz eines separaten, wandmontierten Temperaturstellers oder die Einbindung des Gerätes in das Gebäudemanagement.